法律分析：工程保证金适用诉讼时效，诉讼时效三年，我国法律规定，向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第一百八十 向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。