非法持有毒品原植物幼苗罪的立案条件：
1、行为人非法持有5千株以上罂粟幼苗的，应予立案；
2、非法持有5万株以上大麻幼苗的，应予立案；
3、非法持有其他毒品原植物幼苗数量达到较大标准的，应予立案。
【法律依据】
《最高人民、关于机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（三）》第
非法买卖、运输、携带、持有未经灭活的罂粟等毒品原植物种子或者幼苗，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
（一）罂粟种子五十克以上、罂粟幼苗五千株以上；
（二）大麻种子五十千克以上、大麻幼苗五万株以上；
（三）其他毒品原植物种子、幼苗数量较大的。